292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3708 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  64 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.76 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.17 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.38 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.59 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  51.59 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.79 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.79 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.8 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  51.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.41 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.41 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.62 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.59 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.21 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.03 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.81 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.73 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  45.16 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.56 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.35 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  43.2 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.85 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.2 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.67 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.03 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.17 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.97 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.16 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.28 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1067  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0424191  normal  0.0417111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2248  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  39.84 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.4 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2895  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731384  normal  0.0954896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 		 543 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0803536  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0410  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.575603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.93 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2891  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.08 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1785  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2462  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2819  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0417  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2836  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.74 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2775  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.8 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.93 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.98 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2166  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0845  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.82 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0505159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.54 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  39.17 
 
 		 196 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.53 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.02 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>