288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1058 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1058  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1152  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.36 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1247  4'-phosphopantetheinyl transferase  82.58 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019749  unclonable  0.0000000106801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1041  4'-phosphopantetheinyl transferase  79.55 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.02 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2762  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.7 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1163  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.18 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.211721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1352  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1249  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.42 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2926  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2844  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.712393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2925  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.89 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1205  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.67 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3108  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.67 
 
 		 127 aa  136  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000299312  normal  0.0184251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3022  4'-phosphopantetheinyl transferase  67.94 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0398332  normal  0.769901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1282  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.91 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0790463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.96 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  52.67 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.73 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.15 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  51.15 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.31 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.62 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.62 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.15 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.38 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.23 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.85 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.85 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.85 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  47.37 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.62 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.56 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.67 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.27 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.54 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  39.39 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  44.27 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.61 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.42 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.11 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 139 aa  85.9  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.51 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.44 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.51 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.96 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.51 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0796  Holo-acyl carrier protein synthase  47.69 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.86 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.96 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.31 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.85 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.58 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.5 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.71 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.71 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.85 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.03 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.78 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.15 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1351  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.86 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0301322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.78 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.56 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.41 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.97 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.97 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.88 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>