83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1504 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  265  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.65 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.67 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  34.25 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  34.25 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  30.93 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  30.93 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  30.93 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  31.58 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  33.67 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  32.98 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  36.56 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0599  hypothetical protein  31.31 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  31.52 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  31.96 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  29.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  25.81 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  31 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  29.79 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  29.79 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  29.79 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  30.3 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  27.72 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  34.07 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.79 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  30.53 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  29.29 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  25.81 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  25.81 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  29.35 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  28.72 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  29 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  31.52 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  26.6 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  28.72 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  27.27 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  32.88 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  27.27 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  25.26 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  31.87 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  31.4 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0419  hypothetical protein  28.09 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  26.6 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  32.53 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 		 95 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0432  hypothetical protein  27.72 
 
 		 118 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0442  hypothetical protein  27.72 
 
 		 118 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0183199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  31 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  27.17 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  28.24 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  34.94 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  30.14 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  28.42 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>