30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1060 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  100 
 
 		 527 aa  1090    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  28.69 
 
 		 606 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  27.1 
 
 		 578 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.21 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.71 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.86 
 
 		 579 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  25.81 
 
 		 559 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  26.69 
 
 		 551 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  25.91 
 
 		 549 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  26.15 
 
 		 563 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  26.15 
 
 		 563 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  28.9 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.95 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  26.57 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  26.64 
 
 		 324 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  24.86 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  26.42 
 
 		 540 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  23.93 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  25.16 
 
 		 541 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  23.12 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  26.81 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  22.42 
 
 		 573 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  22.01 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  26.49 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  26.49 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  26.49 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0844  PhoH family protein  23.84 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  27.08 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  25.83 
 
 		 555 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  25.83 
 
 		 555 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>