47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0037 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
331 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  71.3 
 
 
331 aa  517  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  70.39 
 
 
331 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  66.47 
 
 
331 aa  475  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  66.47 
 
 
331 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  62.54 
 
 
331 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  61.52 
 
 
332 aa  434  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  52.11 
 
 
333 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  53.44 
 
 
332 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  50.91 
 
 
334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  50.16 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  50.77 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  50.61 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  52.29 
 
 
337 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  49.54 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  47.92 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  49.31 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  31.62 
 
 
233 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.8 
 
 
255 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  32.23 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  33.33 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  33.08 
 
 
249 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  27.41 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  27.41 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  25.78 
 
 
254 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  25.27 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  22.96 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.17 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  27.07 
 
 
257 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.37 
 
 
231 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  25.56 
 
 
262 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  24 
 
 
220 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.25 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.98 
 
 
244 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
233 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.52 
 
 
227 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.41 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.13 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.87 
 
 
241 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  21.93 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  23.47 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.64 
 
 
240 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.34 
 
 
227 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.34 
 
 
227 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.74 
 
 
255 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.35 
 
 
233 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>