More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3625 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  63.2 
 
 
568 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  100 
 
 
578 aa  1139    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  63.15 
 
 
568 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  63.03 
 
 
568 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  93.71 
 
 
573 aa  1012    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  44.09 
 
 
585 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  44.23 
 
 
585 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  44.28 
 
 
590 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  43.58 
 
 
591 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  43.41 
 
 
585 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  44.05 
 
 
585 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  40.61 
 
 
560 aa  422  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  44.23 
 
 
585 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  43.41 
 
 
585 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  43.41 
 
 
585 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  43.41 
 
 
585 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  43.56 
 
 
576 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  44.96 
 
 
567 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  43.82 
 
 
579 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  43.82 
 
 
579 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  44.55 
 
 
592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  40.96 
 
 
600 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40.79 
 
 
574 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  40.4 
 
 
565 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  44.64 
 
 
569 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  43.05 
 
 
578 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  39.75 
 
 
573 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  40.21 
 
 
595 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  38.41 
 
 
580 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  39.56 
 
 
570 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  40.47 
 
 
575 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  39.38 
 
 
570 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  43.1 
 
 
592 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  39.13 
 
 
596 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  39.2 
 
 
570 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  39.2 
 
 
579 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  38.38 
 
 
575 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  38.96 
 
 
576 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  37.39 
 
 
583 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  40.25 
 
 
574 aa  349  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  39.25 
 
 
566 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  38.22 
 
 
559 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  37.39 
 
 
586 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  38.29 
 
 
590 aa  333  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  38.22 
 
 
592 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  38.41 
 
 
590 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  37.64 
 
 
569 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  38.19 
 
 
587 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  38.03 
 
 
556 aa  320  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  37.07 
 
 
582 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  36.28 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  39.37 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.94 
 
 
569 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  34.8 
 
 
605 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.94 
 
 
569 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  35.5 
 
 
563 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  36.33 
 
 
591 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.22 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.22 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  35.22 
 
 
610 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  35.22 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.22 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.22 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.22 
 
 
610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  34.21 
 
 
585 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.08 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.83 
 
 
588 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  31.84 
 
 
575 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  31 
 
 
584 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  33.4 
 
 
565 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  30.32 
 
 
571 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  35.17 
 
 
576 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  34.21 
 
 
599 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.81 
 
 
572 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  29.83 
 
 
566 aa  257  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  34.91 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  37.92 
 
 
581 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  32.28 
 
 
576 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  32.95 
 
 
583 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  30.34 
 
 
585 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.86 
 
 
586 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.35 
 
 
573 aa  250  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  28.8 
 
 
574 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.68 
 
 
576 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  32.34 
 
 
574 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  32.47 
 
 
550 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  30.88 
 
 
567 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  32.14 
 
 
557 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  33.09 
 
 
588 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  33.95 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  36.52 
 
 
570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.65 
 
 
578 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.1 
 
 
585 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  34.32 
 
 
556 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.11 
 
 
590 aa  236  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  30.73 
 
 
570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.58 
 
 
592 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  30.42 
 
 
565 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  32.54 
 
 
556 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  34.45 
 
 
551 aa  233  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>