20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1832 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  323  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  87.82 
 
 		 167 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  68.99 
 
 		 161 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  65.61 
 
 		 161 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  71.43 
 
 		 161 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  64.74 
 
 		 159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  64.15 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  64.33 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  62.34 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  61.44 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  61.69 
 
 		 154 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  28.23 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  25.81 
 
 		 181 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2225  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  25.16 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 224 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1932  hypothetical protein  31.58 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00511783  normal  0.127352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>