30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0489 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  82.08 
 
 
320 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  80.19 
 
 
318 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  62.89 
 
 
320 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  36.73 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  32.24 
 
 
321 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  31.94 
 
 
327 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  33.81 
 
 
321 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  29.02 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1693  hypothetical protein  28.52 
 
 
303 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  31.11 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  28.37 
 
 
307 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  28.37 
 
 
307 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  27.24 
 
 
305 aa  99  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  28.68 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  27.5 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  25.1 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0022  hypothetical protein  36.71 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  20.83 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  21.99 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  37.29 
 
 
889 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  37.29 
 
 
864 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  37.29 
 
 
889 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  37.29 
 
 
889 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  37.29 
 
 
864 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  37.5 
 
 
853 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  37.29 
 
 
864 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  35.37 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  20.82 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  25.44 
 
 
316 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>