35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1821 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  94.39 
 
 
321 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  39.64 
 
 
327 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  37.89 
 
 
324 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1693  hypothetical protein  36.49 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  32.52 
 
 
304 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  33.81 
 
 
318 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  33.45 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  32.38 
 
 
320 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  31.78 
 
 
320 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  28.85 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  28.28 
 
 
308 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  29.85 
 
 
307 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  30.22 
 
 
307 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  29.43 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  27.12 
 
 
316 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  25.81 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0022  hypothetical protein  36.94 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  26.94 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  26.72 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  21.48 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  40.54 
 
 
850 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  40.54 
 
 
850 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  41.67 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  39.19 
 
 
850 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  38.71 
 
 
360 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  38.03 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  56.76 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  41.94 
 
 
844 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  50 
 
 
877 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  50 
 
 
877 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  40.32 
 
 
844 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  39.13 
 
 
864 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  19.6 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  21.19 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>