34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2122 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  32.8 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  27.78 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  33.68 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  27.99 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  24.22 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  28.84 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  35.17 
 
 
451 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  23.25 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  28.84 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  32.92 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  30.07 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1693  hypothetical protein  28.75 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  22.33 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  25.2 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  24.33 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  29.9 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  30.21 
 
 
360 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  23.57 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  25.58 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  22.44 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0022  hypothetical protein  32.53 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  36.78 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  30.94 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  26.23 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  40.51 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  37 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  40.91 
 
 
327 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  28.46 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  36.27 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  25.95 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  26.32 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>