147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0383 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  98.61 
 
 		 72 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  60.34 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  54.41 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  60.34 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  60.34 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  54.69 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.89 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  59.65 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  62 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  58.93 
 
 		 58 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  56.36 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  54.84 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  56.14 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  57.14 
 
 		 58 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  54.55 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  56.9 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  54.39 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  51.79 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.39 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  54.39 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  47.06 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.73 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  49.12 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  50.91 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  44.26 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  44.62 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  47.17 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  43.86 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  45.28 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  45.61 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  49.06 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  43.86 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  43.08 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  50.91 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  50.91 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  48 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  52.08 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  49.06 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  42.59 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.59 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.59 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.17 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.76 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  47.37 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0526  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  46.3 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.3 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.3 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.3 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.94 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1527  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  47.06 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.92 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2510  RNA-binding S4  46.3 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2454  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2524  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  unclonable  0.0000273439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2616  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000166621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  45.28 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  47.17 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  40.74 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  37.74 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  44.44 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  40.74 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  38.6 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  35.21 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  43.4 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  47.92 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  44 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  44 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  42.31 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2468  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.6 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  40.35 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0414  RNA-binding S4 domain protein  53.45 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0499509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00478  predicted RNA-binding protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3085  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000297466  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0629  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306723  normal  0.860883 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00483  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.325601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0985  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523788  normal  0.0666799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2932  hypothetical protein  35.19 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.503316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0569  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000593229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3094  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0573  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0326332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0446  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000152535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1346  hypothetical protein  34.48 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>