126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0972 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  100 
 
 		 58 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  96.55 
 
 		 58 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  94.83 
 
 		 58 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  86.21 
 
 		 82 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  58.62 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  59.65 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  57.89 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  58.93 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  58 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  63.16 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  64.58 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  57.14 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  56.14 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  62.5 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  62 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  66.67 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  64.58 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.42 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  66.67 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  66.67 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  58.18 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  60.42 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  49.12 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  55.17 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  58.33 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  60 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  52 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  56.25 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  58.33 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  50 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.42 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  56 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  56.25 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  54.17 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  54.17 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  47.27 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  52.17 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  56.25 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.35 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  56.25 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  56 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  50 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  54.17 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  56 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  56 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.79 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  52.08 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  52 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.08 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  47.92 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  47.92 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1527  RNA-binding S4 domain-containing protein  48 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  46 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  47.92 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  46 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  40.35 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  43.1 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  53.7 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  45.83 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  41.82 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  46 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  46 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  52.17 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  42 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  47.92 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  47.92 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  43.14 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  52.17 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  43.48 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  46 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  39.29 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  42 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2510  RNA-binding S4  46.43 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1687  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1581  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0305147  normal  0.476483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  43.64 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>