22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_21122 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_21122  predicted protein  100 
 
 		 447 aa  940    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28827  predicted protein  76.98 
 
 		 444 aa  712    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12139  predicted protein  78.32 
 
 		 447 aa  712    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84476  Tubulin beta chain (Beta tubulin)  68.55 
 
 		 448 aa  659    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01182  Tubulin beta-1 chain (Beta-1-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10653]  74.36 
 
 		 447 aa  673    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06838  Tubulin beta-2 chain (Beta-2-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10874]  68.76 
 
 		 449 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03260  beta1-tubulin, putative  73.74 
 
 		 447 aa  687    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00427493  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06670  Tubulin beta chain, putative  55.97 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.849819  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54534  predicted protein  42 
 
 		 451 aa  362  5.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02810  alpha tubulin, putative  39.96 
 
 		 448 aa  362  6e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89181  Tubulin alpha chain  41.7 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  0.168385 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07570  Tubulin alpha-2 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24634]  41.16 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23506  normal  0.256932 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33239  predicted protein  40.78 
 
 		 452 aa  349  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00514267  normal  0.249426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00316  Tubulin alpha-1 chain [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P24633]  39.4 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0671525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26788  predicted protein  39.82 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.786535  hitchhiker  0.00567726 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00676  Tubulin gamma chain (Gamma-tubulin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P18695]  33.11 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372387  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00170  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  34.94 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585998  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44225  predicted protein  34.19 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.768572  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119480  gamma tubulin  33.49 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.171432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10627  hypothetical protein  37.24 
 
 		 389 aa  276  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.980847 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28162  Gamma tubulin  28.57 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0897404  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05082  Miscellaneous Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.13 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.797796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>