26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49725 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_49725  predicted protein  100 
 
 
401 aa  833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00466519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  27.52 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  23.81 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.92 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  25.85 
 
 
261 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  22.97 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  28.29 
 
 
279 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  21.2 
 
 
478 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  22.88 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  29.94 
 
 
487 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  22.37 
 
 
496 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  22.37 
 
 
498 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  22.37 
 
 
508 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  20.95 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  20.95 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  20.95 
 
 
483 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  22.37 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  22.37 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  22.37 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  20.65 
 
 
480 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  20.95 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  21.71 
 
 
507 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  21.71 
 
 
501 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25.78 
 
 
229 aa  43.5  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  21.71 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  21.62 
 
 
564 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>