29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39238 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  100 
 
 
591 aa  1194    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  26.48 
 
 
692 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  27.37 
 
 
466 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  29.67 
 
 
464 aa  60.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  25.2 
 
 
770 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  25.63 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  21.89 
 
 
471 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  28.93 
 
 
432 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
1608 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  32.35 
 
 
620 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40174  predicted protein  26.52 
 
 
897 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  27.98 
 
 
1048 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  24.5 
 
 
815 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1120  hypothetical protein  19.86 
 
 
781 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  24.68 
 
 
916 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7574  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.66 
 
 
385 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1227  hypothetical protein  22.03 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0725  hypothetical protein  24.07 
 
 
510 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.426015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  25.94 
 
 
522 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  27.41 
 
 
241 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1007  hypothetical protein  26.76 
 
 
295 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1383  hypothetical protein  25.57 
 
 
465 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  24.79 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  24.79 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1800  GALA protein  26.67 
 
 
401 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0919922 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54869  predicted protein  28.78 
 
 
445 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2399  leucine rich repeat protein  23.71 
 
 
368 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  27.04 
 
 
981 aa  43.9  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49435  predicted protein  32.77 
 
 
675 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>