More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35164 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35164  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
357 aa  737    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
249 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  37.15 
 
 
248 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  37.4 
 
 
270 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  38.28 
 
 
247 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  36.96 
 
 
248 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  36.96 
 
 
248 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  37.4 
 
 
247 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  36.08 
 
 
248 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  37.01 
 
 
248 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
248 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  36.58 
 
 
248 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
250 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
270 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 
293 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  35.69 
 
 
247 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  38.13 
 
 
247 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
436 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
252 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  35.52 
 
 
247 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  35.43 
 
 
248 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  36.86 
 
 
248 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  36.13 
 
 
249 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  34.63 
 
 
250 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  34.15 
 
 
251 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  34.24 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  35.83 
 
 
230 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  36.43 
 
 
247 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  36.19 
 
 
234 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  36.61 
 
 
247 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  35.69 
 
 
247 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  36.19 
 
 
247 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  38.61 
 
 
249 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  37.31 
 
 
248 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  35.8 
 
 
247 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  34.65 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  34.65 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  34.98 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  35.8 
 
 
247 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  34.98 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  35.66 
 
 
248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  34.78 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  34.63 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  33.94 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  36.96 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  33.59 
 
 
248 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  35.83 
 
 
230 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  35.83 
 
 
232 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  35.77 
 
 
247 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  35.4 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  35.43 
 
 
233 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  34.31 
 
 
249 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  36.22 
 
 
229 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  35.66 
 
 
248 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  35.04 
 
 
245 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  34.88 
 
 
250 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  35.04 
 
 
245 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  36.43 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  36.19 
 
 
245 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  35.02 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  34.63 
 
 
234 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  34.25 
 
 
245 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  34.11 
 
 
250 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  34.25 
 
 
245 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  34.25 
 
 
245 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  34.88 
 
 
267 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  34.42 
 
 
333 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  35.52 
 
 
247 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0981  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
240 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.632698 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  33.45 
 
 
306 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  35.83 
 
 
249 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  34.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  34.63 
 
 
248 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  36.08 
 
 
249 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  33.72 
 
 
250 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  35.16 
 
 
246 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  34.25 
 
 
245 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  34.25 
 
 
245 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  33.46 
 
 
249 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  36.19 
 
 
228 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>