53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4515 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  100 
 
 
123 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  67.77 
 
 
122 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  67.77 
 
 
122 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0651  transporter protein  57.73 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.282773  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  33.63 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  33.93 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  33.61 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.61 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  32.14 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  35.29 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  35.4 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  35.4 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  34.17 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  34.45 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  34.45 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  32.71 
 
 
267 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  34.45 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  35.04 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  28.57 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.65 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.77 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.77 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  33.33 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.77 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  34.48 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  33.04 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  33.04 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  33.04 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.33 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  29.25 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  38.57 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  28.04 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  30.39 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  27.59 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  28.04 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.66 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  26.47 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0236  hypothetical protein  31.63 
 
 
112 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000529249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  31.88 
 
 
297 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  40.3 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  32.93 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  28.28 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>