22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0236 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000529249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.73 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  33.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  32.84 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  32.84 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.86 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  35.82 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  32.43 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  33 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  29.79 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  35.59 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  26.32 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  32.86 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  34.29 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  30.39 
 
 		 275 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  40.35 
 
 		 278 aa  40.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>