37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3960 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4551  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1225  hypothetical protein  45.32 
 
 
176 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1255  hypothetical protein  48.06 
 
 
191 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1281  hypothetical protein  36.52 
 
 
230 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.582719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4788  hypothetical protein  44.12 
 
 
99 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.175046  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  32.67 
 
 
1141 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  34.35 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0054  hypothetical protein  43.66 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3007  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117805  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1972  hypothetical protein  40.32 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.83 
 
 
440 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
566 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  45.65 
 
 
570 aa  47.4  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  38.46 
 
 
2725 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
553 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  47.83 
 
 
561 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
554 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.38 
 
 
568 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  52.38 
 
 
568 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.38 
 
 
568 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3835  hypothetical protein  31.73 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  37.5 
 
 
552 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  44 
 
 
561 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  29.7 
 
 
551 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.82 
 
 
571 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.3 
 
 
564 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  30.36 
 
 
356 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0431  hypothetical protein  46.51 
 
 
65 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  48.94 
 
 
599 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.38 
 
 
566 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  29.37 
 
 
249 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.51 
 
 
568 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.51 
 
 
559 aa  40.8  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  46.81 
 
 
599 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  47.06 
 
 
391 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.65 
 
 
553 aa  40.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>