95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0022 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  94.12 
 
 		 85 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0031  hypothetical protein  71.76 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  58.14 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  63.53 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0036  protein of unknown function DUF1471  70.59 
 
 		 85 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  56.47 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  51.76 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  50.59 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  54.65 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  56.98 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  54.65 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  54.65 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  54.65 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  54.65 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  58.14 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0739  protein of unknown function DUF1471  58.82 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  49.41 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  48.86 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  50.6 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  47.67 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  63.51 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  55.29 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  51.69 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  51.16 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  44.19 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  46.05 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2648  hypothetical protein  55.81 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158517  hitchhiker  0.000000615567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  44.74 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  44.74 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1392  hypothetical protein  52.33 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  46.05 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  43.68 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  41.86 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  41.86 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0102  protein of unknown function DUF1471  51.81 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  42.53 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  42.53 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0056  protein of unknown function DUF1471  52.94 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  36.78 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1293  hypothetical protein  50.94 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0654658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  41.57 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4082  hypothetical protein  38.82 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.714562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  38.16 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1393  hypothetical protein  48.84 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2621  hypothetical protein  37.21 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  38.96 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3987  hypothetical protein  31.46 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3747  hypothetical protein  31.46 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0166  hypothetical protein  31.46 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.650256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3050  hypothetical protein  31.65 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.391134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3824  hypothetical protein  32.22 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>