52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  96.99 
 
 		 166 aa  323  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  68.89 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  60.84 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  61.36 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  61.31 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  61.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  55.86 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  56.55 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.48 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  55.32 
 
 		 196 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  59.85 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  59.85 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  60.47 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  61.65 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  59.69 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  57.14 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.86 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  60.98 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  58.14 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  58.14 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  58.14 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  49.66 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  54.93 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  51.97 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  55.22 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.55 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  35.04 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  36.72 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  31.29 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  33.86 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  32.19 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.19 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.46 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.5 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  29.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.15 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  24.19 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  29.81 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  29.81 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  23.42 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 167 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  32.05 
 
 		 276 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>