More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0601 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 471 aa  967    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.93 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 		 456 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  45.7 
 
 		 473 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.37 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.36 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.36 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  47.36 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 460 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 		 462 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  41.93 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  46.92 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  47.14 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  47.14 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  46.48 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  46.48 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  46.48 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  48.24 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  43.62 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  43.54 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  46.64 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.18 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  43.64 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  43.64 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.48 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  44.4 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  42.01 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  46.26 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  43.42 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  46.58 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.8 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.05 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  43.3 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  45.67 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  43.2 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.08 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  42.15 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  42.83 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  42.83 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  43.32 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  42.14 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.7 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  41.33 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  43.74 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.26 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 457 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  41.74 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  43.52 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  41.79 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  43.83 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  44.93 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2234  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.36 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0025864  normal  0.861147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  41.33 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  40.39 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>