28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17621 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  100 
 
 		 491 aa  1018    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  48.37 
 
 		 780 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  48.59 
 
 		 871 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13384  predicted protein  40.46 
 
 		 594 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  48.48 
 
 		 881 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  37.77 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  26.97 
 
 		 344 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  28.05 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  28.05 
 
 		 344 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  27.49 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  23.19 
 
 		 326 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  25.65 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  27.54 
 
 		 342 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  23.92 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  21.34 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  23.21 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  23.44 
 
 		 365 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  22.34 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  22.76 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  24.32 
 
 		 345 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  25.29 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  25.65 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  25.29 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  23.59 
 
 		 341 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  21.03 
 
 		 336 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  21.45 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  23.37 
 
 		 420 aa  43.5  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  26.02 
 
 		 372 aa  43.5  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>