More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2409 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 
391 aa  58.9  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 
541 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  32.71 
 
 
541 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 
541 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2012  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.07 
 
 
414 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  31.78 
 
 
541 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.36 
 
 
541 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
199 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.68 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30.56 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  32.41 
 
 
276 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.94 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  29.19 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.51 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  29.19 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
235 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5415  Protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  34.26 
 
 
388 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324501  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.57 
 
 
251 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.19 
 
 
251 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.19 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  29.19 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3677  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  43.24 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.59 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  33.08 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.19 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.65 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2602  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  37.65 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.96 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.91 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
283 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  27.95 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  31.48 
 
 
1085 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4918  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.62 
 
 
409 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.074362  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
246 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.46 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1128  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  37.5 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1666  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2173  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  33.33 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2044  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2569  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0736  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  32.63 
 
 
330 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3063  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3124  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  38.96 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase, putative  35.21 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.17 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0960  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  40.28 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3099  putative protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.63 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3924  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.76 
 
 
217 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.63 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.14 
 
 
241 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.63 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.89 
 
 
232 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.85 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  29.14 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  29.08 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.57 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.07 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.43 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
262 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35.29 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.32 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.21 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  52.17 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
268 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  37.36 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.86 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.73 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.89 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.64 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.73 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.32 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0912  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  35.21 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>