96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0068 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0068  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0216  transcriptional regulator, AbrB family  70.43 
 
 
186 aa  264  6e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.643498  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0113  AbrB family transcriptional regulator  67.74 
 
 
186 aa  259  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.11816e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0133  transcriptional regulator, AbrB family  67.39 
 
 
180 aa  253  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74992e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0083  AbrB family transcriptional regulator  69.02 
 
 
183 aa  252  2e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0165891  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0073  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 
186 aa  250  8e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2071  transcriptional regulator, AbrB family  65.57 
 
 
183 aa  241  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0080  AbrB family transcriptional regulator  66.31 
 
 
186 aa  239  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0183  transcriptional regulator, AbrB family  65.22 
 
 
180 aa  238  3e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2655  AbrB family transcriptional regulator  61.96 
 
 
183 aa  232  2e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3088  transcriptional regulator, AbrB family  59.78 
 
 
184 aa  230  8e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.37828e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2805  stage V sprulation protein T  60.33 
 
 
182 aa  215  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2491  stage V sprulation protein T  60.33 
 
 
182 aa  215  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0595  AbrB family transcriptional regulator  58.15 
 
 
183 aa  214  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0049  AbrB family transcriptional regulator  59.78 
 
 
178 aa  213  1e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0049  transcriptional regulator, AbrB family  60.87 
 
 
178 aa  212  3e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0051  transcriptional regulator, AbrB family  60.87 
 
 
178 aa  211  6e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0053  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0049  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0053  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0060  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5257  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  210  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0049  stage V sporulation protein T  59.24 
 
 
178 aa  210  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0052  stage V sporulation protein T  58.7 
 
 
178 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0063  stage V sporulation protein T  58.7 
 
 
178 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1006  transcriptional regulator, AbrB family  52.17 
 
 
183 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000308031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0059  stage V sporulation protein T  58.7 
 
 
178 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0049  AbrB family transcriptional regulator  59.24 
 
 
178 aa  207  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0127  AbrB family transcriptional regulator  56.52 
 
 
181 aa  206  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.12675e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21190  transcriptional regulator, AbrB family  57.3 
 
 
185 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.609479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1244  transcriptional regulator, AbrB family  43.09 
 
 
172 aa  140  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.35967  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06360  transcriptional regulator, AbrB family  72.55 
 
 
86 aa  77  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.68493e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05890  transcriptional regulator, AbrB family  59.38 
 
 
80 aa  73.9  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2116  transcriptional regulator, AbrB family  70.59 
 
 
89 aa  73.9  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.58986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0059  transition state regulatory protein AbrB  50 
 
 
92 aa  72.8  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0251658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3909  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 
85 aa  71.2  8e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0032  AbrB family transcriptional regulator  45.26 
 
 
94 aa  70.5  1e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0105  transcriptional regulator, AbrB family  68.63 
 
 
86 aa  70.5  1e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.45761e-10  unclonable  1.74996e-10 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3130  transcriptional regulator, AbrB family  68.63 
 
 
80 aa  70.5  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0040  AbrB family transcriptional regulator  68.63 
 
 
84 aa  70.9  1e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0507223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0035  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0046  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0032  AbrB family transcriptional regulator  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0036  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0033  transition state transcriptional regulatory protein  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0033  transition state transcriptional regulatory protein  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0493749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0065  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
89 aa  69.7  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.25498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5274  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0034  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 
94 aa  70.1  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0277  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 
79 aa  68.9  3e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  3.9637e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0064  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 
86 aa  69.3  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  4.48918e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0268  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 
79 aa  68.9  3e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  4.26571e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0030  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
99 aa  68.9  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0062  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 
83 aa  68.6  4e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63043e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0047  transcription regulator AbrB  55.56 
 
 
83 aa  68.9  4e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.08345e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0164  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
79 aa  68.6  5e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  6.9654e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0047  AbrB family transcriptional regulator  57.81 
 
 
85 aa  68.6  5e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.90016e-13  hitchhiker  3.2494e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0032  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
99 aa  68.2  6e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3312  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
81 aa  67.8  8e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.101256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3070  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
81 aa  67.8  8e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0194  transition state regulatory protein AbrB  63.27 
 
 
92 aa  67  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0127  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 
80 aa  66.6  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  8.36565e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0173  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 
80 aa  65.9  3e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.01689e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1863  AbrB family transcriptional regulator  62.75 
 
 
95 aa  65.9  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0995656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0042  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 
83 aa  66.2  3e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2000  transition state transcriptional regulatory protein  45.95 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2097  putative transition state transcriptional regulatory protein  45.95 
 
 
95 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1812  transition state regulatory protein  45.95 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.950306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1828  transition state regulatory protein, abrB  45.95 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1858  transition state transcriptional regulatory protein  45.95 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2077  transition state transcriptional regulatory protein, putative  45.95 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2100  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 
79 aa  65.5  4e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.45229e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2034  putative transition state transcriptional regulatory protein  60.78 
 
 
95 aa  65.5  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40938e-30 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2936  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 
84 aa  65.1  6e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.14981e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2375  transition state regulatory protein AbrB  52.24 
 
 
93 aa  65.1  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.371411  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0235  transition state regulatory protein, AbrB  59.18 
 
 
92 aa  64.7  7e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0146221  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0021  transition state regulatory protein  59.18 
 
 
92 aa  63.9  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3307  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.86 
 
 
95 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2002  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.86 
 
 
95 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0187  transition state regulatory protein AbrB  57.14 
 
 
92 aa  62.8  3e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.21307e-05  hitchhiker  2.32472e-39 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1839  AbrB family transcriptional regulator  46.58 
 
 
92 aa  62.8  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0045089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2992  AbrB family transcriptional regulator  59.18 
 
 
87 aa  60.8  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.828454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2724  transition state regulatory protein AbrB  44.78 
 
 
92 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00162837  hitchhiker  0.00326326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2217  transition state regulatory protein AbrB  48.44 
 
 
92 aa  58.2  7e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2883  transition state regulatory protein AbrB  55.77 
 
 
92 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1724  transition state regulatory protein  44.29 
 
 
93 aa  55.8  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2453  transition state regulatory protein AbrB  55.77 
 
 
92 aa  55.5  4e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2600  transition state regulatory protein AbrB  46.88 
 
 
92 aa  54.3  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0487  transcriptional regulator, AbrB family  39.47 
 
 
83 aa  53.5  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00969946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0618  transcriptional regulator, AbrB family  49.02 
 
 
83 aa  51.6  6e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000296518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1204  transcriptional regulator, AbrB family  47.06 
 
 
82 aa  51.2  7e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  5.4071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0598  transcriptional regulator, AbrB family  36.78 
 
 
82 aa  50.8  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3032  transcriptional regulator, AbrB family  44 
 
 
90 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.83 
 
 
686 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01658e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>