95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3909 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3909  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  167  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0047  transcription regulator AbrB  62.03 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000208345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2116  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0047  AbrB family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000190016  hitchhiker  0.0000032494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05890  transcriptional regulator, AbrB family  60.26 
 
 		 80 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0173  transcriptional regulator, AbrB family  64.56 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000901689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0062  AbrB family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0127  transcriptional regulator, AbrB family  61.04 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000836565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0164  transcriptional regulator, AbrB family  62.03 
 
 		 79 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000069654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0040  AbrB family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0507223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0064  AbrB family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000448918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06360  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0268  AbrB family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000426571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0277  AbrB family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000039637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2100  AbrB family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000145229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0065  transcriptional regulator, AbrB family  56.79 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.25498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0105  transcriptional regulator, AbrB family  61.64 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000445761  unclonable  0.000000000174996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3070  transcriptional regulator, AbrB family  58.44 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3312  transcriptional regulator, AbrB family  58.44 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.101256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0042  transcriptional regulator, AbrB family  53.09 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2936  transcriptional regulator, AbrB family  51.95 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000614981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0021  transition state regulatory protein  54.55 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0032  AbrB family transcriptional regulator  74 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0035  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0032  AbrB family transcriptional regulator  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0046  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5274  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0034  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0033  transition state transcriptional regulatory protein  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0493749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0036  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  74 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0033  transition state transcriptional regulatory protein  74 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3130  transcriptional regulator, AbrB family  49.35 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0487  transcriptional regulator, AbrB family  48.78 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00969946  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0194  transition state regulatory protein AbrB  64.41 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0032  transcriptional regulator, AbrB family  70 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0030  transcriptional regulator, AbrB family  70 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0059  transition state regulatory protein AbrB  63.64 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0251658  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0235  transition state regulatory protein, AbrB  67.31 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0146221  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0187  transition state regulatory protein AbrB  67.31 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000321307  hitchhiker  2.32472e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1863  AbrB family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0995656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2034  putative transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4093800000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2000  transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2097  putative transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2077  transition state transcriptional regulatory protein, putative  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1858  transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1828  transition state regulatory protein, abrB  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1812  transition state regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.950306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1244  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.35967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0052  stage V sporulation protein T  51.35 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3307  putative transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2002  putative transition state transcriptional regulatory protein  61.54 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0080  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0059  stage V sporulation protein T  51.35 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0049  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0063  stage V sporulation protein T  51.35 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0068  transcriptional regulator, AbrB family  64.71 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0133  transcriptional regulator, AbrB family  64.71 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000474992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0216  transcriptional regulator, AbrB family  64.71 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.643498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0113  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0595  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0083  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0165891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0053  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0127  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000412675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0049  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0049  AbrB family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0060  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0053  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5257  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0049  stage V sporulation protein T  62.75 
 
 		 178 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0049  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3088  transcriptional regulator, AbrB family  62.75 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000437828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0183  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0051  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0073  AbrB family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2375  transition state regulatory protein AbrB  61.54 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.371411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1006  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2655  AbrB family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2071  transcriptional regulator, AbrB family  62.75 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21190  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.609479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2491  stage V sprulation protein T  60.78 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2805  stage V sprulation protein T  60.78 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2883  transition state regulatory protein AbrB  57.14 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2217  transition state regulatory protein AbrB  50 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2453  transition state regulatory protein AbrB  44.44 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3032  transcriptional regulator, AbrB family  42.5 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1839  AbrB family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0045089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2724  transition state regulatory protein AbrB  49.12 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00162837  hitchhiker  0.00326326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1204  transcriptional regulator, AbrB family  45.16 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000054071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2600  transition state regulatory protein AbrB  50 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2992  AbrB family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.828454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0618  transcriptional regulator, AbrB family  43.55 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000296518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1724  transition state regulatory protein  56 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0598  transcriptional regulator, AbrB family  45.83 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>