More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0061 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
322 aa  655  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.56 
 
 
317 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.86 
 
 
315 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  439  1e-122  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 
314 aa  438  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.24 
 
 
317 aa  440  1e-122  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.38 
 
 
316 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.03 
 
 
313 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.99 
 
 
315 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  67.83 
 
 
316 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.61912e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
315 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.71 
 
 
325 aa  431  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.09 
 
 
322 aa  431  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  62.9 
 
 
317 aa  424  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.19 
 
 
318 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.87 
 
 
317 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.74 
 
 
329 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  3.42806e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.03 
 
 
319 aa  404  1e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.34 
 
 
319 aa  406  1e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 
319 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
314 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.117e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  58.71 
 
 
327 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.68 
 
 
321 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
338 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.37 
 
 
321 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
318 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.25 
 
 
330 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
318 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.37 
 
 
321 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
338 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.16 
 
 
316 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.49 
 
 
316 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.77 
 
 
330 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.73 
 
 
331 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
324 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.52 
 
 
316 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.8681e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  55.1 
 
 
326 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  7.60299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
320 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
323 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.95 
 
 
314 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
314 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.30674e-06  hitchhiker  8.48542e-11 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  57.93 
 
 
312 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.13984e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.94 
 
 
359 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  2.1567e-06  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.77 
 
 
309 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
325 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.99 
 
 
309 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
321 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.63 
 
 
314 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.47 
 
 
327 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  54.46 
 
 
321 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.74 
 
 
309 aa  362  5e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
315 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
316 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.27 
 
 
330 aa  359  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.75 
 
 
312 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
329 aa  358  7e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
315 aa  358  7e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.67857e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
309 aa  358  9e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
311 aa  357  1e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
314 aa  357  1e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 
324 aa  357  1e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.69 
 
 
320 aa  357  2e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.49461e-09 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
324 aa  356  2e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.82 
 
 
331 aa  357  2e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.63 
 
 
324 aa  357  2e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  54.11 
 
 
319 aa  357  2e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
325 aa  356  3e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.09 
 
 
312 aa  356  3e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
324 aa  355  4e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.66 
 
 
320 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
337 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
311 aa  353  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
331 aa  353  3e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
318 aa  352  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
321 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  54.11 
 
 
321 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
320 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
316 aa  351  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
315 aa  350  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
324 aa  350  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.89 
 
 
322 aa  351  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.49 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
315 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>