102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0042 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0042  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 83 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0047  transcription regulator AbrB  69.51 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000208345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0277  AbrB family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 79 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000039637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0268  AbrB family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 79 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000426571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0062  AbrB family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0127  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000836565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0173  transcriptional regulator, AbrB family  67.09 
 
 		 80 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000901689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0047  AbrB family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000190016  hitchhiker  0.0000032494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0040  AbrB family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0507223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0064  AbrB family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 86 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000448918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2100  AbrB family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000145229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05890  transcriptional regulator, AbrB family  60 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2116  transcriptional regulator, AbrB family  59.04 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0164  transcriptional regulator, AbrB family  63.29 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000069654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3070  transcriptional regulator, AbrB family  60.49 
 
 		 81 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3312  transcriptional regulator, AbrB family  60.49 
 
 		 81 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.101256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0065  transcriptional regulator, AbrB family  58.75 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.25498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0105  transcriptional regulator, AbrB family  65.33 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000445761  unclonable  0.000000000174996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06360  transcriptional regulator, AbrB family  55.7 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2936  transcriptional regulator, AbrB family  50.63 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000614981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3909  AbrB family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3130  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0035  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0036  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0033  transition state transcriptional regulatory protein  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0033  transition state transcriptional regulatory protein  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0493749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0034  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0032  AbrB family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0046  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5274  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  54.12 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0032  AbrB family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0618  transcriptional regulator, AbrB family  44.58 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000296518  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0021  transition state regulatory protein  63.79 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0059  transition state regulatory protein AbrB  56.34 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0251658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0032  transcriptional regulator, AbrB family  60.32 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0030  transcriptional regulator, AbrB family  60.32 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0194  transition state regulatory protein AbrB  60 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2217  transition state regulatory protein AbrB  52.38 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2375  transition state regulatory protein AbrB  55.38 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.371411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3032  transcriptional regulator, AbrB family  42.68 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2600  transition state regulatory protein AbrB  56.67 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1204  transcriptional regulator, AbrB family  39.76 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000054071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2002  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.92 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3307  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.92 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282754 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0235  transition state regulatory protein, AbrB  55.38 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0146221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2724  transition state regulatory protein AbrB  50.79 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00162837  hitchhiker  0.00326326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1863  AbrB family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0995656  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0187  transition state regulatory protein AbrB  55.38 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000321307  hitchhiker  2.32472e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2883  transition state regulatory protein AbrB  58.62 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2077  transition state transcriptional regulatory protein, putative  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1858  transition state transcriptional regulatory protein  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1828  transition state regulatory protein, abrB  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1812  transition state regulatory protein  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.950306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2000  transition state transcriptional regulatory protein  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2097  putative transition state transcriptional regulatory protein  53.85 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2453  transition state regulatory protein AbrB  56.9 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1839  AbrB family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0045089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2034  putative transition state transcriptional regulatory protein  62.96 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4093800000000004e-30 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0595  AbrB family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1244  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.35967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0487  transcriptional regulator, AbrB family  41.98 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00969946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1724  transition state regulatory protein  42.35 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0080  AbrB family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2992  AbrB family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.828454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0049  AbrB family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0052  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0053  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0049  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0049  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0053  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0049  AbrB family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0068  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0063  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0059  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5257  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0060  stage V sporulation protein T  49.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0133  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000474992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3088  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000437828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0083  AbrB family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0165891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2655  AbrB family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0113  AbrB family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0127  AbrB family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000412675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0183  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0216  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.643498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0049  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0051  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2071  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0073  AbrB family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1006  transcriptional regulator, AbrB family  56.86 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2805  stage V sprulation protein T  58.82 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2491  stage V sprulation protein T  58.82 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21190  transcriptional regulator, AbrB family  56.86 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.609479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0598  transcriptional regulator, AbrB family  43.75 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3410  prophage LambdaBa01, AbrB family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.648162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3492  prophage LambdaBa01, AbrB family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000250344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3769  prophage lambdaba01, AbrB family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000957175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3787  prophage LambdaBa02, AbrB family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1166  AbrB family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000565949  normal  0.132039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>