56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4623 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  100 
 
 		 427 aa  833    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  43.72 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  39.77 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  40.66 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  38.72 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  42.56 
 
 		 484 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  40.85 
 
 		 513 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  46.33 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  44.85 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  38.71 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  40.37 
 
 		 397 aa  216  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  43.29 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  43.87 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  38.75 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  37.57 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  40.26 
 
 		 599 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  38.15 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  46.42 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  38.65 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  43.62 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  44.63 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  39.25 
 
 		 410 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  44.08 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  38.98 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  38.98 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  34.07 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  37.97 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  31.75 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  27.54 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  37.15 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  27.47 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  30.58 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  30 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  28.05 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  28.68 
 
 		 409 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  28.35 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  26.33 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  28 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  27.68 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  31.11 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.3 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  24.35 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  26.77 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  30.14 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.75 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  26.83 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  24.35 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  24.35 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.42 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.42 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  24.42 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  24.14 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  23.08 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  22.51 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  25.69 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>