41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1236 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  34.41 
 
 		 454 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.43 
 
 		 216 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  33.85 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  32.99 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  33.7 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  34.13 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  34.13 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  34.13 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  32.02 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  26.22 
 
 		 358 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  29.76 
 
 		 503 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  30.5 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  28.57 
 
 		 530 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  26.07 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  26.29 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  31.61 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  31.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  31.08 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  35.82 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  30.32 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  31.85 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  23.29 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  30.25 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  32.3 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  29.2 
 
 		 173 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.77 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  29.87 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  32.7 
 
 		 179 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  29.07 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  29.86 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>