61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4087 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
173 aa  348  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  90.17 
 
 
173 aa  313  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  61.4 
 
 
182 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  56.21 
 
 
186 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  54.22 
 
 
181 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  51.2 
 
 
167 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  51.2 
 
 
167 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  47.09 
 
 
204 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  47.2 
 
 
202 aa  154  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  46.75 
 
 
179 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  41.32 
 
 
225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  42.44 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  47.74 
 
 
174 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  48.34 
 
 
170 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  45.03 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.03 
 
 
197 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  43.87 
 
 
197 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  44.59 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  38.93 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  37.13 
 
 
189 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  42.38 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  39.53 
 
 
189 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.48 
 
 
177 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  38.96 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  42.96 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  42.96 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  39.75 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  40.28 
 
 
167 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  38.93 
 
 
192 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  43.36 
 
 
164 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  41.56 
 
 
213 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  40.91 
 
 
164 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  40.79 
 
 
185 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  40.16 
 
 
171 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  38.26 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  40.13 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  35.81 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  30.72 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  30.77 
 
 
503 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  29.59 
 
 
503 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  33.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.72 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  31.28 
 
 
288 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  27.21 
 
 
218 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  30.47 
 
 
358 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  29.71 
 
 
530 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  32.98 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.59 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  28.77 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  26.89 
 
 
454 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  30.34 
 
 
220 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  26.28 
 
 
217 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  26.28 
 
 
217 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  27.68 
 
 
248 aa  44.7  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.19 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 
314 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  29.71 
 
 
248 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>