22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3179 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  33.15 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  32.35 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  30.87 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  34.04 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.71 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  32.77 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  26.09 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.09 
 
 		 530 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  27.86 
 
 		 503 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  30.82 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  24.14 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  25.74 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  25.74 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.08 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  24.26 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  30.82 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  33.57 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  30.43 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  28.86 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>