More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1598 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  68.1 
 
 
582 aa  743  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  54.51 
 
 
559 aa  642  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  66.61 
 
 
581 aa  764  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  65.53 
 
 
582 aa  756  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  65.64 
 
 
581 aa  773  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  67.88 
 
 
582 aa  747  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  69.02 
 
 
584 aa  789  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  53.36 
 
 
560 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.48 
 
 
592 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.75 
 
 
561 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.29 
 
 
558 aa  571  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.47 
 
 
559 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  47.5 
 
 
568 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.03 
 
 
559 aa  461  1e-128  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  38.1 
 
 
561 aa  408  1e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.98772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.46 
 
 
561 aa  399  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  37.78 
 
 
563 aa  399  1e-110  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  40 
 
 
544 aa  399  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  40.35 
 
 
544 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.63 
 
 
561 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  39.2 
 
 
543 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  38.68 
 
 
543 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  38.68 
 
 
556 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  35.37 
 
 
560 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  34.84 
 
 
560 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  36.52 
 
 
565 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.86884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.8 
 
 
559 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  38.25 
 
 
560 aa  349  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  37.52 
 
 
546 aa  343  6e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  31.66 
 
 
564 aa  342  8e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  34.14 
 
 
558 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.85 
 
 
554 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.1 
 
 
559 aa  331  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  32.29 
 
 
556 aa  325  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.38 
 
 
558 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.27 
 
 
557 aa  321  2e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  34.9 
 
 
586 aa  322  2e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 
558 aa  315  1e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.14 
 
 
558 aa  313  8e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.74003e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  33.87 
 
 
551 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  33.62 
 
 
599 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.62 
 
 
557 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.81 
 
 
559 aa  308  2e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.45 
 
 
562 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.51 
 
 
547 aa  303  5e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.02 
 
 
501 aa  303  6e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.2 
 
 
501 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  34.6 
 
 
558 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  37.85 
 
 
552 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.04 
 
 
557 aa  294  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.87 
 
 
560 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.98 
 
 
547 aa  288  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.5 
 
 
552 aa  286  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  32.96 
 
 
557 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.91 
 
 
544 aa  284  3e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.02 
 
 
558 aa  282  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.77 
 
 
557 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.27 
 
 
557 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  36.55 
 
 
558 aa  279  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.97 
 
 
549 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.21 
 
 
555 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.2 
 
 
556 aa  276  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  31.43 
 
 
559 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  35.51 
 
 
652 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.98 
 
 
555 aa  268  3e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.78 
 
 
573 aa  268  3e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.08 
 
 
571 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.6 
 
 
549 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  29.9 
 
 
547 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.18 
 
 
549 aa  263  5e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 
585 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29 
 
 
549 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  29.6 
 
 
547 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  28.81 
 
 
549 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.8 
 
 
578 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.36 
 
 
565 aa  255  2e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.39 
 
 
561 aa  253  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  30.99 
 
 
582 aa  251  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  9.24249e-08  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.41 
 
 
550 aa  249  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.02 
 
 
563 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.92 
 
 
549 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.79 
 
 
537 aa  247  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.27 
 
 
565 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.27 
 
 
565 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  28.84 
 
 
556 aa  245  1e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.14 
 
 
537 aa  245  2e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.46 
 
 
553 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 
561 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 
584 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  32.57 
 
 
542 aa  241  3e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  36.77 
 
 
538 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.94 
 
 
533 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.15 
 
 
533 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.94 
 
 
509 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.68 
 
 
530 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.98 
 
 
537 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  28.99 
 
 
586 aa  235  1e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  28.88 
 
 
571 aa  235  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.39 
 
 
547 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>