44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3210 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  79.01 
 
 
238 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  61.63 
 
 
250 aa  300  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  57.25 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  61.61 
 
 
225 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  25.65 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  27.75 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  26.06 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  27.71 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  27.42 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  25.79 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2822  hypothetical protein  24.74 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000140103  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  24.61 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  24.86 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  24.74 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  24.74 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  24.46 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1689  hypothetical protein  27.23 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.078896  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3789  hypothetical protein  27.23 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  24.34 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  27.51 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1533  hypothetical protein  24.21 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1473  hypothetical cytosolic protein  25.71 
 
 
274 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0705  hypothetical protein  25.71 
 
 
274 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000381885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  23.78 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  28.74 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1432  hypothetical protein  22.34 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24260  hypothetical protein  24.6 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2054  hypothetical protein  24.6 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0469689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2199  hypothetical protein  26.88 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18720  hypothetical protein  24.14 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0277254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  26.73 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  26.13 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  22.63 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4399  hypothetical protein  24.12 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  21.76 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2586  hypothetical protein  22.7 
 
 
273 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801355  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2752  hypothetical protein  24.08 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3726  hypothetical protein  25.27 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1548  hypothetical protein  24.19 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2016  hypothetical protein  25.27 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2940  hypothetical protein  25.67 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0231953  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2741  hypothetical protein  37.65 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1576  hypothetical protein  23.12 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967103  normal  0.21157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>