23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0400 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  68.92 
 
 
251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  61.61 
 
 
256 aa  272  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  59.64 
 
 
238 aa  261  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  57.01 
 
 
250 aa  250  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  25.65 
 
 
297 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02030  hypothetical protein  25.52 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  23.03 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003741  hypothetical protein  24.47 
 
 
274 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.439263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1689  hypothetical protein  28.19 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0658  hypothetical protein  29.06 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2631  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1355  hypothetical protein  24.62 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2738  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1718  hypothetical protein  26.46 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1499  hypothetical protein  25.65 
 
 
284 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000002161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1398  hypothetical protein  25.13 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2166  hypothetical protein  25.25 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2564  hypothetical protein  24.47 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3170  hypothetical protein  25.26 
 
 
271 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0508487  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1311  hypothetical protein  35.8 
 
 
286 aa  42  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1562  hypothetical protein  24.08 
 
 
273 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  0.486429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1529  hypothetical protein  24.08 
 
 
273 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000187706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>