13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01910  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  620  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.35674  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1077  hypothetical protein  52.35 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000260914  hitchhiker  0.0000000000012089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1345  hypothetical protein  32.44 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1050  hypothetical protein  29.17 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2324  hypothetical protein  27.07 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.580961  normal  0.646475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1287  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3210  hypothetical protein  27.71 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2741  hypothetical protein  29.29 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3031  hypothetical protein  30.25 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0400  hypothetical protein  25.65 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4822  hypothetical protein  31.43 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2805  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1721  hypothetical protein  33.9 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>