32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0015 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  326  1e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  90.24 
 
 
164 aa  303  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  75.61 
 
 
164 aa  250  5e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  70.73 
 
 
164 aa  242  1e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  67.68 
 
 
164 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  69.51 
 
 
164 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  61.59 
 
 
164 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  54.66 
 
 
168 aa  172  1e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  48.17 
 
 
163 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  47.56 
 
 
162 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  48.17 
 
 
163 aa  146  1e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  50 
 
 
167 aa  145  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  48.17 
 
 
163 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  46.91 
 
 
167 aa  132  2e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  48.17 
 
 
163 aa  132  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  47.56 
 
 
179 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  47.02 
 
 
168 aa  130  1e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  45.73 
 
 
162 aa  129  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  47.56 
 
 
163 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  45.33 
 
 
151 aa  125  4e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
151 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
151 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  43.33 
 
 
151 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  38.36 
 
 
173 aa  115  4e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  40.79 
 
 
158 aa  109  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  42 
 
 
151 aa  108  2e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  39.1 
 
 
134 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  37.66 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  67.8  7e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  56.2  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  38 
 
 
151 aa  50.4  1e-05  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>