247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4227 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  61.36 
 
 
90 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.55 
 
 
89 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.81 
 
 
90 aa  90.1  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.56 
 
 
90 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.14 
 
 
88 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  44.57 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  44.57 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  43.82 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.45 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  44.32 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  46.84 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  41.57 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.57 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  42.39 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  42.05 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.2 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.45 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.44 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  41.57 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1951  phosphoryl transfer system HPr  43.62 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000513673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  43.82 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.18 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.78 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  37.65 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  46.25 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0882  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000535519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  42.05 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.91 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  48.44 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.9 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  40.45 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.55 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.24 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.37 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  46.48 
 
 
691 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  37.08 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  36.36 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1462  phosphocarrier, HPr family  43.18 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  34.09 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  37.08 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  35.23 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2138  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.54 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.580759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  32.56 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  35.71 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  36.9 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  34.09 
 
 
90 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.55 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.43 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.3 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.9 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0103  phosphocarrier protein HPr  32.56 
 
 
88 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0536118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  30.23 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.23 
 
 
90 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  28.24 
 
 
94 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  34.94 
 
 
86 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4945  phosphocarrier protein Chr  37.31 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29360  Phosphocarrier protein HPr/PTS system IIA component  34.18 
 
 
231 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.521811  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.71 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3695  phosphocarrier protein Chr  35 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  41.67 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  34.94 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  35.9 
 
 
85 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.14 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1021  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.71 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  40.3 
 
 
89 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0669  phosphocarrier protein HPr  27.91 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.829245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5256  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5001  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4830  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5686  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4845  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5237  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5381  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  37.97 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5313  phosphocarrier protein Chr  35.82 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0187  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  43.64 
 
 
837 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2048  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  42.62 
 
 
838 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.488537  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16870  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  38.2 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.288242  normal  0.471923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  36.71 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  31.87 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  35.37 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  32.93 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  30.59 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2902  HPrNtr  36.05 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  27.91 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1243  phosphocarrier protein HPr  35.82 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.691712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.25 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  27.91 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  32.56 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>