More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2195 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  100 
 
 
358 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  58.89 
 
 
361 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  55.93 
 
 
381 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  58.95 
 
 
375 aa  351  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  59.62 
 
 
362 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  57.26 
 
 
361 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  58.15 
 
 
433 aa  331  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  39.9 
 
 
406 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  53.82 
 
 
344 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.9 
 
 
397 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  40.15 
 
 
397 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  39.65 
 
 
406 aa  289  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.39 
 
 
401 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  39.29 
 
 
397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  39.39 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  38.94 
 
 
403 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  38.69 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  38.75 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  39.54 
 
 
396 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  36.48 
 
 
399 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  38.05 
 
 
397 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  36.87 
 
 
398 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  36.02 
 
 
398 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  43.48 
 
 
589 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  35.93 
 
 
398 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  36.99 
 
 
397 aa  275  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.53 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  37.5 
 
 
398 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44.41 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.81 
 
 
397 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  36.93 
 
 
401 aa  272  6e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  37.03 
 
 
398 aa  272  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  44.33 
 
 
394 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  41.37 
 
 
398 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  39.07 
 
 
397 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.92 
 
 
404 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  46.19 
 
 
395 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  47.74 
 
 
381 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.25 
 
 
397 aa  270  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  41.77 
 
 
393 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  42.36 
 
 
404 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  42.04 
 
 
404 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  42.71 
 
 
391 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  42.36 
 
 
401 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  43.08 
 
 
405 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  44.15 
 
 
378 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  37.09 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  37.56 
 
 
398 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  37.91 
 
 
402 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.52 
 
 
399 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  41.84 
 
 
411 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  37.63 
 
 
408 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  36.2 
 
 
397 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  42.06 
 
 
405 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  43.85 
 
 
402 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  40.26 
 
 
422 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  42.25 
 
 
593 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  35.86 
 
 
396 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  35.86 
 
 
396 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  43.72 
 
 
402 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  35.49 
 
 
394 aa  263  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  38.5 
 
 
401 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  35.44 
 
 
399 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  38.54 
 
 
398 aa  262  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  37.89 
 
 
417 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  35.43 
 
 
399 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  37.91 
 
 
421 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  40.05 
 
 
398 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  37.34 
 
 
404 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  34.42 
 
 
396 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  36.5 
 
 
395 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  44.62 
 
 
386 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  37.78 
 
 
399 aa  259  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  37.79 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  37.79 
 
 
400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  41.92 
 
 
400 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  35.35 
 
 
398 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  34.68 
 
 
399 aa  258  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  42.6 
 
 
394 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  36.87 
 
 
396 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  35.73 
 
 
398 aa  258  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  42.89 
 
 
389 aa  258  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  46.51 
 
 
372 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  42.71 
 
 
394 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  41.75 
 
 
407 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  36.25 
 
 
397 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  41.72 
 
 
405 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  34.65 
 
 
406 aa  256  3e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  42.67 
 
 
394 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  43.01 
 
 
386 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  41.1 
 
 
401 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  41.15 
 
 
404 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>