More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4030 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4030  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  100 
 
 
445 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  46.37 
 
 
676 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.58 
 
 
603 aa  262  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  40.09 
 
 
609 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.61 
 
 
647 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  37.56 
 
 
625 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  38 
 
 
625 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  35.5 
 
 
668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
624 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
624 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
624 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  36.3 
 
 
626 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.14 
 
 
681 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.55 
 
 
635 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.84 
 
 
664 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  35.37 
 
 
618 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.55 
 
 
613 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
681 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.61 
 
 
702 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.82 
 
 
700 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35 
 
 
615 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
691 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.31 
 
 
693 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.23 
 
 
601 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.09 
 
 
668 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
691 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
700 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
582 aa  216  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.23 
 
 
594 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
598 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.43 
 
 
627 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  32.09 
 
 
656 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.29 
 
 
613 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
657 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
657 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
657 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.81 
 
 
657 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  42.05 
 
 
661 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.56 
 
 
627 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
632 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 
703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.07 
 
 
648 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.26 
 
 
668 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.76 
 
 
650 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.01 
 
 
625 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.53 
 
 
520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  39.08 
 
 
736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35.86 
 
 
638 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.13 
 
 
653 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
690 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.93 
 
 
641 aa  179  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.07 
 
 
584 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.14 
 
 
645 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  39.33 
 
 
758 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.43 
 
 
632 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.41 
 
 
667 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
646 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.16 
 
 
634 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
612 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.57 
 
 
692 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.22 
 
 
579 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.29 
 
 
614 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  30.11 
 
 
667 aa  170  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
666 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
651 aa  168  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.21 
 
 
593 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.12 
 
 
652 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.15 
 
 
662 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  34.44 
 
 
519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  29.5 
 
 
692 aa  163  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
450 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.29 
 
 
604 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
590 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
468 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.95 
 
 
658 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.22 
 
 
591 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.07 
 
 
662 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.85 
 
 
715 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.26 
 
 
602 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.3 
 
 
675 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.52 
 
 
621 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.01 
 
 
614 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  35.33 
 
 
450 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
480 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
573 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.14 
 
 
916 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
592 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
503 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.05 
 
 
880 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  36.13 
 
 
623 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
588 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>