More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3730 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3730  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
249 aa  503  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542099  normal  0.363647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  93.17 
 
 
249 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102494  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5226  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  92.37 
 
 
249 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1034  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  91.16 
 
 
249 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92586  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4385  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  74.6 
 
 
251 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4766  hypothetical protein  74.6 
 
 
251 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4472  hypothetical protein  74.6 
 
 
251 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.783879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05130  Fe-S oxidoreductase  70.45 
 
 
267 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  70.12 
 
 
246 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3104  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  65.85 
 
 
267 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1755  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  68.95 
 
 
257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0891  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  68.95 
 
 
264 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  64.66 
 
 
247 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  64.63 
 
 
244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  63.16 
 
 
247 aa  312  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12950  Fe-S oxidoreductase  62.35 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0443672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  64.05 
 
 
246 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19840  Fe-S oxidoreductase  58.59 
 
 
284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  62.45 
 
 
243 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  63.07 
 
 
248 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.71 
 
 
246 aa  295  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.07 
 
 
227 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.87 
 
 
270 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  57.09 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3243  hypothetical protein  58.09 
 
 
234 aa  271  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2425  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.47 
 
 
244 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00338747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.44 
 
 
248 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2001  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  54.47 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000985814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.63 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.74 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  44.49 
 
 
260 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.83 
 
 
244 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  45.04 
 
 
239 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.26 
 
 
242 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  44.21 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.03 
 
 
239 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  44.21 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.43 
 
 
242 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  38.02 
 
 
242 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  38.02 
 
 
242 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.89 
 
 
247 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  43.8 
 
 
239 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  44.35 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  38.37 
 
 
245 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  39.43 
 
 
248 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0709  hypothetical protein  38.75 
 
 
243 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.162619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  37.45 
 
 
256 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  40.08 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  40.08 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  40.08 
 
 
239 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.84 
 
 
239 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  44.81 
 
 
247 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  39.67 
 
 
239 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.26 
 
 
239 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.56 
 
 
241 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.49 
 
 
246 aa  184  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2768  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.32 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.83 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.15 
 
 
241 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  42.08 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  38.02 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  42.15 
 
 
241 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.52 
 
 
247 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  44.4 
 
 
249 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.67 
 
 
239 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.68 
 
 
239 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.56 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3622  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.08 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.92 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.08 
 
 
244 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.57 
 
 
248 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.13 
 
 
246 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  39.67 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  40.08 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  41.3 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  41.3 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  41.3 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  40.41 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  41.3 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  41.3 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.31 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  42.74 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  41.06 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  43.31 
 
 
259 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  42.91 
 
 
247 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  40.89 
 
 
268 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2946  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.65 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2838  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.94 
 
 
247 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0236915  normal  0.339029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>