65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1694 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.04 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.04 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  66.27 
 
 		 99 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.2 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  61.29 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.8 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  66.67 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.76 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.14 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.45 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.82 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.44 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  66.23 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.11 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.11 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.11 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.1 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56.52 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.25 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.53 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.67 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.16 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.04 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  58.44 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.81 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.41 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.4 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.54 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  46.81 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  45.65 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  45.65 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  44.95 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.44 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.56 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.35 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.82 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.82 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.07 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.11 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.95 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1251  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1760  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.71 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.614449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  34.33 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.96 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2245  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.18 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.028928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.87 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.87 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.82 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0910653  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.41 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  39.13 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  37.23 
 
 		 108 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1663  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.32 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.23 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0785  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.77 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0698  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1474  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.38 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0420721  normal  0.0886147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.41 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 92 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.41 
 
 		 97 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>