217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0555 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 601 aa  1207    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  45.33 
 
 		 608 aa  485  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  50.11 
 
 		 483 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  50.91 
 
 		 425 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  39.27 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  41.54 
 
 		 624 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  40.18 
 
 		 620 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  40.3 
 
 		 613 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  48.71 
 
 		 422 aa  359  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  39.71 
 
 		 645 aa  335  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  50.83 
 
 		 318 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  48.39 
 
 		 343 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  48.06 
 
 		 343 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  49.17 
 
 		 334 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  48.21 
 
 		 331 aa  316  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  42.3 
 
 		 418 aa  316  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  44.17 
 
 		 412 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  49.33 
 
 		 343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  44.72 
 
 		 456 aa  296  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  44.01 
 
 		 332 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  41.25 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  44.29 
 
 		 306 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  45.61 
 
 		 434 aa  250  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  49.82 
 
 		 331 aa  249  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  44.15 
 
 		 338 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  42.66 
 
 		 307 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  42.61 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  42.61 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  44.48 
 
 		 347 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  41.37 
 
 		 335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  41.37 
 
 		 335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  41.37 
 
 		 335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  44.11 
 
 		 310 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  44.11 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  44.11 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  43.43 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  43.77 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  44.11 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  44.11 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  43.1 
 
 		 310 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  43.1 
 
 		 310 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  43.06 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  40.47 
 
 		 330 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  40.14 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  40.14 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.74 
 
 		 310 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  47.37 
 
 		 317 aa  233  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  39.8 
 
 		 326 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  39.8 
 
 		 326 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  39.8 
 
 		 326 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  44.21 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  41.45 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  39.8 
 
 		 326 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  39.46 
 
 		 326 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  39.46 
 
 		 326 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  43.05 
 
 		 346 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  44.52 
 
 		 304 aa  223  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04560  glutaminase  31.27 
 
 		 615 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393943  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  38.26 
 
 		 313 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  41.46 
 
 		 307 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  41.4 
 
 		 333 aa  220  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  41.11 
 
 		 307 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  44.01 
 
 		 306 aa  217  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  43.3 
 
 		 315 aa  218  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  44.36 
 
 		 304 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  44 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  42.55 
 
 		 309 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  43.26 
 
 		 309 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  42.75 
 
 		 304 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  43.62 
 
 		 311 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  39.64 
 
 		 309 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  42.91 
 
 		 304 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  42.91 
 
 		 304 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  42.91 
 
 		 304 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  42.75 
 
 		 304 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  44.69 
 
 		 311 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  42.2 
 
 		 311 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  42.7 
 
 		 304 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  42.21 
 
 		 308 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  42.55 
 
 		 304 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  38.93 
 
 		 309 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  43.25 
 
 		 309 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  38.18 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  42.91 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  38.57 
 
 		 309 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  45.02 
 
 		 309 aa  206  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  42.61 
 
 		 309 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  38.57 
 
 		 309 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  44.4 
 
 		 309 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>