18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4112 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  70.95 
 
 		 168 aa  225  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  35.97 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  38.64 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  34.33 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  38.84 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  32.14 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  27.86 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  35.51 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  31.85 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  38.33 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  26.85 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  27.27 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  30.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  29.27 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  26.06 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  31.75 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>