36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1886 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  100 
 
 		 139 aa  275  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 136 aa  233  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  83.2 
 
 		 134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  83.2 
 
 		 134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  83.2 
 
 		 134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  76 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  67.94 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  56.15 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  59.02 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  54.76 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  54.03 
 
 		 138 aa  143  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  60 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  53.28 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  50.39 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  47.97 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  47.11 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  48.44 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  54.84 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  47.15 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.53 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  29.46 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 		 1177 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  26.09 
 
 		 736 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 917 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 228 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.69 
 
 		 703 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>