17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0420 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  908    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  75.42 
 
 
482 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  68 
 
 
464 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  68.41 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  60.16 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  68.97 
 
 
444 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  36.57 
 
 
472 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  36.57 
 
 
472 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  27.68 
 
 
464 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  32.77 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  24.07 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  26.21 
 
 
528 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  28.23 
 
 
508 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  33.33 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  28.78 
 
 
484 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  30.47 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  31.54 
 
 
472 aa  43.5  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>