More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1253 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  100 
 
 
465 aa  936    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  59.87 
 
 
469 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  59.23 
 
 
472 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  51.2 
 
 
462 aa  458  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  46.88 
 
 
468 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  47.85 
 
 
465 aa  428  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  48.8 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  51.07 
 
 
465 aa  413  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  47.6 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  47.6 
 
 
468 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  47.38 
 
 
468 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  45.2 
 
 
465 aa  389  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  45.06 
 
 
463 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  40.95 
 
 
467 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  42.61 
 
 
467 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  42.18 
 
 
466 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  43.01 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  43.35 
 
 
470 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  41.59 
 
 
478 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  40.17 
 
 
823 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.15 
 
 
819 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.31 
 
 
817 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.09 
 
 
823 aa  319  7.999999999999999e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.85 
 
 
819 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.35 
 
 
815 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.28 
 
 
819 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.48 
 
 
818 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.12 
 
 
835 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  36.72 
 
 
818 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  37.37 
 
 
468 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.74 
 
 
815 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.88 
 
 
834 aa  292  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.7 
 
 
815 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.09 
 
 
822 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.27 
 
 
835 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  35.85 
 
 
815 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.05 
 
 
835 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  36.32 
 
 
471 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.61 
 
 
820 aa  272  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  36.05 
 
 
814 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  36 
 
 
471 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  31.63 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  31.78 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  34.05 
 
 
541 aa  253  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  34.78 
 
 
870 aa  249  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  34.05 
 
 
471 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  34.55 
 
 
471 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  34.76 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
819 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.76 
 
 
822 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  34.75 
 
 
471 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.4 
 
 
822 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.97 
 
 
822 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
822 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
822 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 
822 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.56 
 
 
818 aa  236  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.12 
 
 
822 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.76 
 
 
822 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
819 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
819 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.76 
 
 
822 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.19 
 
 
822 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 
819 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.76 
 
 
818 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  33.33 
 
 
810 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.62 
 
 
819 aa  233  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.62 
 
 
819 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  33.83 
 
 
471 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  31.99 
 
 
463 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.77 
 
 
820 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.77 
 
 
820 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.69 
 
 
820 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.42 
 
 
819 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.12 
 
 
821 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  31.42 
 
 
820 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  31.42 
 
 
820 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  32.11 
 
 
456 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.21 
 
 
818 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.21 
 
 
820 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.42 
 
 
820 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.74 
 
 
819 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  33.19 
 
 
446 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  32.32 
 
 
451 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.68 
 
 
469 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.36 
 
 
819 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.27 
 
 
821 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.98 
 
 
820 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.68 
 
 
821 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.33 
 
 
820 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31 
 
 
821 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  31.02 
 
 
450 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.76 
 
 
821 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>