51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2456 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  41.05 
 
 		 1136 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  55.38 
 
 		 1094 aa  1169    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 1076 aa  2185    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  55.23 
 
 		 1100 aa  1171    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  38.47 
 
 		 1169 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1117 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1117 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1095 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  35.57 
 
 		 1145 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1113 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  48.42 
 
 		 1195 aa  353  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  24.02 
 
 		 2860 aa  68.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.47 
 
 		 2859 aa  63.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  22.8 
 
 		 2880 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  29.72 
 
 		 2932 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  29.79 
 
 		 2786 aa  62  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  26.5 
 
 		 2887 aa  59.7  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  23.11 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  32.66 
 
 		 2716 aa  57.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.45 
 
 		 2868 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  29.96 
 
 		 2864 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  29.59 
 
 		 2748 aa  55.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  29.27 
 
 		 2833 aa  55.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  25.99 
 
 		 2922 aa  55.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  24.74 
 
 		 849 aa  55.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  24.42 
 
 		 624 aa  55.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  29.72 
 
 		 1303 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  28.89 
 
 		 2874 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  28.76 
 
 		 2868 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  28.33 
 
 		 2831 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  26.89 
 
 		 2845 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  27.97 
 
 		 2875 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  20.82 
 
 		 786 aa  52.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  21.91 
 
 		 831 aa  52  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  27.39 
 
 		 2916 aa  51.2  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  26.76 
 
 		 2730 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  25.84 
 
 		 815 aa  50.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  25.57 
 
 		 2839 aa  49.3  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  29.61 
 
 		 2758 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  24.71 
 
 		 785 aa  48.9  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.24 
 
 		 2748 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  27.6 
 
 		 2842 aa  48.5  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  22.53 
 
 		 797 aa  48.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  24.26 
 
 		 784 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.58 
 
 		 2839 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  29.83 
 
 		 2747 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  22.32 
 
 		 797 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  23.08 
 
 		 2905 aa  47  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  28.33 
 
 		 2769 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  24.53 
 
 		 790 aa  45.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  25.5 
 
 		 2823 aa  45.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>