31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1538 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  47.35 
 
 		 739 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  53.62 
 
 		 841 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  46.27 
 
 		 930 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  40.53 
 
 		 845 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  40.31 
 
 		 979 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  44.57 
 
 		 765 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  44.07 
 
 		 759 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  42.35 
 
 		 760 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  39.64 
 
 		 712 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  39.05 
 
 		 712 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  39.05 
 
 		 712 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  39.05 
 
 		 720 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  36.52 
 
 		 351 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  38.17 
 
 		 716 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  39.05 
 
 		 712 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  35.03 
 
 		 682 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  39.74 
 
 		 847 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  40.51 
 
 		 755 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  37.2 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  34.88 
 
 		 731 aa  83.6  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  41.45 
 
 		 838 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  36.2 
 
 		 892 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  33.83 
 
 		 815 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  32.74 
 
 		 654 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  30.52 
 
 		 696 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  41.18 
 
 		 576 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  35.94 
 
 		 650 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  31.72 
 
 		 895 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  30.72 
 
 		 437 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  28.22 
 
 		 732 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>