178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1407 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  100 
 
 		 331 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  59.57 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  58.59 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  58.59 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  58.59 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  55.08 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  53.19 
 
 		 338 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  42.07 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  46.58 
 
 		 425 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  46.1 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  43.23 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  40.26 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  40.98 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  41.31 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  41.31 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  40.98 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  42.76 
 
 		 624 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  45.1 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  42.21 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  42.49 
 
 		 624 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  41 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.45 
 
 		 601 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  39.87 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 613 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  41.21 
 
 		 620 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  40.88 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  41.16 
 
 		 608 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  40.14 
 
 		 422 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  37.33 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  37 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  36.51 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  36.51 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  38.76 
 
 		 418 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  41.11 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  38.98 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  37.85 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  33.01 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  34.9 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  36.77 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  36.42 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  37.98 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  37.98 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  36.3 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  36.3 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  38.11 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  33.33 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  35.97 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  36.36 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  37.11 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  36.01 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  37.5 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  36.9 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  35.81 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  30.54 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  30.54 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  30.54 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  30.54 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  32.69 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  35.37 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  30.2 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  30.2 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  30.2 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  30.2 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  32.25 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  31.92 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  36.39 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  31.92 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  36.89 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  31.82 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  31.49 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  34.84 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  32.69 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  32.99 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  33.01 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  38.06 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  32.68 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  33.33 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  34.11 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  36.73 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  36.73 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  36.05 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  35.15 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  33.1 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  33.1 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>